微生物组研究人员挑战结肠癌生物标志物发现的最新技术

导读 来自 VIB-KU 鲁汶、UZ 鲁汶、杨森制药和多家国际合作者的研究人员首次引入了定量方法和广泛的混杂因素控制,以发现结直肠癌发展中的微生

来自 VIB-KU 鲁汶、UZ 鲁汶、杨森制药和多家国际合作者的研究人员首次引入了定量方法和广泛的混杂因素控制,以发现结直肠癌发展中的微生物组生物标志物。虽然过去有多种微生物类群被提出作为潜在的癌症相关生物标志物,但这项新研究揭示了可能导致错误关联的模糊贡献。结果已发表在《自然医学》上。

过去十年,癌症微生物组研究取得了重大进展,为癌症相关生物标志物带来了新的见解。尽管取得了许多科学进展,但之前的研究主要集中在非定量的描述性生物标志物发现方法上。由 VIB-KU 鲁汶微生物学中心、UZ 鲁汶和杨森制药公司领导的研究现在表明了坚持这些方法的风险。在他们最新的出版物中,他们考虑了微生物组混杂因素和绝对量化,结果令人惊讶。

在这项开创性研究中,研究人员将定量微生物组分析 (QMP) 与来自 589 名处于不同阶段的结肠直肠癌患者的广泛患者表型分析相结合。此外,他们重新分析了 15 项已发表研究的数据,这些研究共涉及 4439 名患者和对照组。研究表明,在没有混杂因素控制的情况下,结果与已发表队列的作者所述结果相同。然而,当结合混杂因素控制和绝对定量方法时,一些先前声称的微生物生物标志物关联被发现是由其他因素而不是癌症诊断驱动的。

这项研究表明,在研究癌症相关生物标志物时,我们必须去伪存真。通过实施混杂因素控制和定量分析,我们能够揭示微生物标志物与结直肠癌发展之间潜在的误导性关联,例如由肠道炎症驱动的关联。– Jeroen Raes 教授,鲁汶天主教大学医学院 VIB-KU 微生物学中心和 Rega 研究所的 PI 和副主任。

该研究确定了转运时间、粪便钙卫蛋白和 BMI 是主要的微生物协变量,超过了传统 CRC 诊断组所解释的方差。令人惊讶的是,在控制这些协变量时,成熟的微生物组-CRC 靶标(如具核梭杆菌)未能与 CRC 诊断组显着相关。相反,该研究强调了阴道厌氧球菌、肺炎支原体、微小细小单胞菌、厌氧消化链球菌、不解糖卟啉单胞菌和中间普雷沃氏菌与 CRC 的密切关联,突出了它们作为未来干预目标的潜力。

这项研究强调了严谨方法在揭示复杂的疾病-微生物组关联方面的重要性。迄今为止,许多发现的目标大多被忽视。- Raul Yhossef Tito-Tadeo,第一作者和 Raes 实验室博士后。

我们的研究结果显示了严格的患者表型分析的重要性。在研究中收集所有这些额外数据是一项艰巨的工作,但值得付出努力。– 鲁汶天主教大学消化肿瘤学组研究经理 Sara Verbandt。

这项研究的临床意义重大。人们迫切需要快速、非侵入性结肠癌诊断方法。目前的筛查工具(例如基于粪便中是否有血液)不够具体,需要进行太多不必要的结肠镜检查,给医疗保健系统带来不必要的负担。

快速、特异的粪便检测将使更多的人能够得到早期筛查,从而避免许多不必要的结肠癌死亡。——萨宾·特杰帕尔 (Sabine Tejpar) 教授,鲁汶大学胃肠病学家、消化肿瘤学组负责人、鲁汶天主教大学医学院教授。

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