调节衰老聚糖时钟的基因网络图谱

导读 一篇新的研究论文发表在《Aging》(被 MEDLINE/PubMed 列为Aging (Albany NY)和 Web of Science 的Aging-US)第15 卷第 24 期,标...

一篇新的研究论文发表在《Aging》(被 MEDLINE/PubMed 列为“Aging (Albany NY)”和 Web of Science 的“Aging-US”)第15 卷第 24 期,标题为: “绘制调节衰老聚糖时钟的基因网络。”

聚糖是免疫球蛋白 G (IgG) 的重要结构成分,可调节其结构和功能。然而,这种复杂的翻译后修饰背后的调控机制尚不清楚。之前的全基因组关联研究 (GWAS) 鉴定了 29 个参与 IgG 糖基化调节的基因组区域,但只有少数得到了功能验证。IgG 糖基化的关键功能特征之一是添加半乳糖(半乳糖基化),这一特征已被证明与衰老相关。

在这项新研究中,研究人员Azra Frkatović-Hodžić、Anika Mijakovac、Karlo Miškec、Arina Nostaeva、Sodbo Z. Sharapov、Arianna Landini、Toomas Haller、Erik van den Akker、Sapna Sharma、Rafael RC Cua​​drat、Massimo Mangino、Yong Li、Toma凯瑟、纳吉达·鲁德曼、塔玛拉·斯塔姆布克、玛雅·普契奇-巴科维奇、伊雷娜·特尔博耶维奇-阿克马契奇、伊万·古德尔吉、耶科·斯塔姆布克、蒂亚·普里比奇、芭芭拉·拉多瓦尼、佩特拉·托米纳克、克里斯塔·费舍尔、玛丽安·比克曼、曼弗雷德·伍尔、克里斯蒂安·吉格、马蒂亚斯·B·舒尔茨、来自 Genos 糖科学研究实验室的 Clemens Wittenbecher、Ozren Polasek、Caroline Hayward、James F. Wilson、Tim D. Spector、Anna Köttgen、Frano Vučković、Yurii S. Aulchenko、Aleksandar Vojta、Jasminka Krištić、Lucija Klarić、Vlatka Zoldoš 和 Gordan Lauc (来自Genos 糖科学研究实验室) ,萨格勒布大学,新西伯利亚国立大学,莫斯科国立罗蒙诺索夫大学,爱丁堡大学, 塔尔图大学,莱顿大学医学中心,代尔夫特理工大学,慕尼黑亥姆霍兹中心,德国糖尿病研究中心 (DZD) ,伦敦国王学院,盖伊大学和圣托马斯基金会信托基金、弗莱堡大学、里耶卡大学、德国人类营养研究所波茨坦-雷布吕克、波茨坦大学、哈佛大学陈曾熙公共卫生学院、查尔姆斯理工大学、斯普利特大学医学院、代数大学学院、约翰·霍普金斯大学彭博公共卫生学院和SB RAS 细胞学与遗传学研究所对 IgG 半乳糖基化 (N=13,705) 进行了 GWAS,并鉴定了 16 个显着相关的位点,表明 IgG 半乳糖基化受到复杂的基因网络的调节,该网络超出了将半乳糖添加到 IgG 聚糖上的半乳糖基转移酶。

“在这里,我们在一项研究中进行了 IgG 半乳糖基化表型的 GWAS,与之前的 IgG N-糖基化 GWAS 相比,样本量几乎增加了一倍 (N=13,705) [ 33 ],并重点关注具有计算机模拟证据的基因参与IgG 半乳糖基化过程。”

基因优先排序确定了 37 个候选基因。利用最近开发的 CRISPR/dCas9 系统,研究人员操纵了体外IgG 表达系统中候选基因的基因表达。EEF1A1、MANBA 和 TNFRSF13B 三个基因的上调改变了 IgG 糖组的组成,这证实了这三个基因参与了该体外表达系统中的 IgG 半乳糖基化。

“需要进一步的研究来充分阐明它们在衰老中的作用背后的功能机制,并揭示调节 IgG 糖基化复杂过程的基因相互作用的完整网络。”

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