HortGenome搜索引擎 (HSE) 推出了一款突破性工具,彻底改变了园艺作物遗传学的探索。HSE 能够快速访问和分析来自 500 多种植物的数据,增强了我们解码复杂遗传网络的能力。此次发布标志着园艺研究的一个关键进步,为人类营养和健康至关重要的作物遗传学提供了详细的见解。
随着基因组学彻底改变了我们对园艺作物的认识,研究人员经常要处理分散而复杂的基因组数据。这种碎片化严重阻碍了有效的分析和应用,因此显然需要更具凝聚力的研究工具。面对日益增长的农业需求,满足这一需求对于充分发挥基因组学洞察力以提高作物质量、多样性和恢复力至关重要。
北京农业大学的研究人员与国际科学家合作,宣布开发了园艺基因组搜索引擎 (HSE),并于 2024 年 4 月 8 日发表在著名期刊《园艺研究》上。该研究 (DOI: 10.1093/hr/uhae100)介绍了一种新型搜索引擎,旨在查询和分析 500 多种园艺作物的基因组数据,增强我们对基因功能和作物改良的理解。
HSE 将来自 500 多种园艺作物的基因组数据整合到一个统一的平台中,提供轻松访问和高效比较遗传信息的功能。HSE 配备了基本局部比对搜索工具 (BLAST) 和同源性查看器等先进工具,简化了基因查询和功能注释流程。批量查询界面和富集分析等功能简化了数据导航,提高了研究效率。该引擎能够识别关键基因家族,如番茄中的 TCP 转录因子,凸显了其在推动基因组研究和农业创新方面的重要作用。HSE
的共同开发者 Zhangjun Fei 博士表示:“HortGenome 搜索引擎是园艺基因组学的一项重要突破,提供了无与伦比的大量基因组数据访问方式。该工具彻底改变了植物基因组研究,大大加快了作物改良的发现和应用。”HSE
不仅简化了基因组研究,而且对作物育种和遗传保护产生了深远影响。通过简化基因组数据访问和分析,HSE 使研究人员能够快速找到与理想性状相关的基因,从而加速培育更有营养、更有弹性、更适合可持续农业实践的作物品种。
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